Zum Zeitpunkt der Einreichung des parlamentarischen Vorstosses, dessen Begehren primär eine Integration des Europainstitutes in die Universität war, stand die Zukunft des Institutes im Mittelpunkt der Diskussionen. Für zwei Aufbauphasen in den Jahren 1993 - 1996 und 1996 - 1999 wurden der Stiftung Europainstitut von den Kantonen Basel-Stadt und Basel-Landschaft im Sinne einer Starthilfe Betriebsmittel zur Verfügung gestellt. Zusätzliche finanzielle Unterstützung erhielt das Europainstitut seit der Gründung durch die Wirtschaft. Mit Beschluss des Universitätsrates vom 6. November 1997 und mit Umsetzung auf Herbst 1998 konnte inzwischen die Vollintegration des Europainstituts in die Universität Basel erreicht werden. Die Aufgabe der privaten Drittmittelbeschaffung durch die Stiftung ist allerdings geblieben; Mittel aus der Wirtschaft werden auch künftig zur Sicherung des Weiterbestands notwendig sein. Für das Erbringen der Leistungen in Lehre und Forschung arbeiten die Juristische Fakultät, die Philosophisch-Historische Fakultät sowie die Wirtschaftswissenschaftliche Fakultät der Universität Basel eng zusammen.

Das Europainstitut ist heute ein interdisziplinäres Institut der Universität Basel. Es bietet nebst weiteren Angeboten einen zweisemestrigen Nachdiplomkurs an, mit dessen Abschluss der akademische Grad eines Master of Advanced European Studies erworben werden kann. Detailinformationen sind auf der Homepage des Europainstitutes (http://www.unibas.ch/euro/index) jederzeit aktuell verfügbar.