Mit Alex Fischer konnte eine bestausgewiesene Persönlichkeit für das Präsidium der Kunstkommission gefunden werden. Alex Fischer tritt an die Stelle von Peter Böckli, welcher das Präsidium niedergelegt hat, jedoch weiterhin in der Kommission verbleibt. Die Kunstkommission begleitet, berät und unterstützt die Museumsdirektion in der Erfüllung ihres kulturellen und wissenschaftlichen Auftrages. Als Mitglieder der Kommission wählen die Universität und der Regierungsrat Persönlichkeiten aus Wissenschaft, Kultur, Wirtschaft und Politik. Die Kommission hat im wesentlichen beratende Funktion. Ihr kommen aber auch gewisse Entscheid-Kompetenzen zu. So beschliesst sie über Ankäufe in die Sammlung sowie über Bewilligungen von Leihgaben. Sie kann Schenkungen und Vermächtnisse annehmen, soweit diese nicht vom Regierungsrat genehmigt werden müssen, und hat insbesondere ein Antragsrecht für die Wahl eines Museumsdirektors oder einer Museumsdirektorin.