Am 1. April 1999 entschloss sich die Christoph Merian Stiftung, der Stadt Basel das erste Literaturhaus der Schweiz überhaupt zu ermöglichen. Rund ein Jahr später, am 7. April 2000, fand die Eröffnung des Literaturhauses Basel mit einem grossen Fest statt. Seither fanden unter der Intendantin Margrit Manz rund 120 Veranstaltungen statt. Bis ins Jahr 2003 wird die Christoph Merian Stiftung für dieses Kulturengagement über 2 Millionen Franken aufgewendet haben.

Anfänglich sah die Christoph Merian Stiftung ihre Rolle darin, ein innovatives Kulturprojekt anzuschieben. Es war geplant, dass längerfristig neue Geldgeber die hauptsächliche Finanzierung des Literaturhauses übernehmen sollten. Leider konnten bis heute trotz intensiver Suche die dazu nötigen Finanzquellen nicht erschlossen werden.

Da die Schliessung des Literaturhauses für die Kulturstadt Basel ein grosser Verlust wäre, wird die Christoph Merian Stiftung das Literaturhaus Basel auch in den Jahren 2004 - 2007 mit insgesamt 1,8 Millionen Franken unterstützen.