Neu sind die Schulen auf Stadtgebiet in vier Schulkreise eingeteilt. Einen fünften Schulkreis bilden die von den Gemeinden Bettingen und Riehen geführten Primarschulen. Für die vom Kanton geführten Schulen gilt: Zu jedem Schulkreis gehören die Primarschulen (inklusive Kindergärten) sowie Orientierungs (OS)- und Weiterbildungsschulen (WBS) des definierten Stadtgebiets und ebenso – wo vorhanden – die sonderschulischen Spezialangebote. Beim Bilden der Schulkreise wurde darauf geachtet, dass sie etwa gleich viele Schulen umfassen und einigermassen ausgewogen sind im Hinblick auf die Zusammensetzung der Bevölkerung. Die Schulkreise bilden aber keine neue Hierarchiestufe zwischen den Schulleitungen eines Standorts und der Volksschulleitung und treten darum in der Öffentlichkeit kaum in Erscheinung. Grundlage für die Schulkreisorganisation und für die Professionalisierung der Schulleitungen bilden die vom Regierungsrat am 26. Juni 2012 beschlossenen Verordnungen Volksschulleitung und Schulleitungen der Volksschulen.

Die Neuorganisation in Schulkreise (vergleiche beiliegende Karte) ist die konsequente Folge davon, die Volksschule über alle Stufen hinweg als Ganzes zu betrachten und die Hürden zwischen den Stufen abzubauen. Sie berücksichtigt, dass es nach der Harmonisierung der Schulen im Kanton Basel-Stadt während der obligatorischen Schulzeit nur noch zwei Schulstufen geben wird: die Primarstufe und die Sekundarstufe. Neu ist ausserdem, dass die Schulleitung zu einer eigenen Profession wird. Die Schulleiterinnen und Schulleiter sind verantwortlich für den Schulbetrieb und Personalverantwortliche der Lehrerinnen und Lehrer. Zur Erfüllung ihrer Aufgaben erhalten sie mehr Leitungszeit.

Der Leiter respektive die Leiterin eines Schulkreises hat die Aufsicht über die Schulleitungen und die Schulstandorte des entsprechenden Stadtgebiets und trägt somit die Verantwortung für die gesamte Schulzeit eines Kindes vom Kindergarten bis zum Ende der obligatorischen Schulzeit. Haben die Eltern ein Anliegen, wenden sie sich zuerst an den Klassenlehrer respektive die Klassenlehrerin. Kann das Problem nicht gelöst werden, ist die Schulleitung die nächste Ansprechperson. Nachher ist der Leiter respektive die Leiterin eines Schulkreises zuständig, wenn notwendig befasst sich am Schluss der Leiter Volksschulen mit dem Anliegen.

Die Leiterinnen und Leiter der neuen Schulkreise sind: Doris Ilg (Schulkreis I), Gaby Jenö (Schulkreis II), Flavio Tiburzi (Schulkreis III), Anita Crain (Schulkreis IV). Die Gemeindeschulen von Bettingen und Riehen bilden einen eigenen Schulkreis mit eigener Organisation. Christian Griss wird neuer Leiter Dienste und in dieser Funktion stellvertretender Leiter Volksschulen.